SD Insan Cendekia Yogyakarta merupakan salah satu sekolah dasar (SD) yang ada di Jogja. SD Insan Cendekia Yogyakarta berdiri pada tahun 2010. Saat ini SD Insan Cendekia sudah mulai dikenal oleh masyarakat luas.

Tahun Ke-	Tahun	Jumlah siswa
1	2010	37
2	2011	79
3	2012	105
4	2013	145
5	2014	189
6	2015	227
7	2016	258

Walaupun usianya yang masih relatif belia, SD Insan Cendekiasudah menorehkan banyak prestasi bahkan terakhir salah satu siswi SD Juara Yogya masuk ke dalam selaksi tahap II Olimpiade Sains Kuark. SD Insan Cendekia yang dicetuskan oleh Pak Habibie, berkoordinasi dengan BPPT dan mendapat support dari Departemen Agama  sehingga biaya sekolahnya gratis tersebut memiliki sistem pendidikan yang sama mulai dari aktifitas kesehariannya seperti hidup di asrama, guru-guru yang standby mendidik selama 24 jam, dan lain sebagainya. Lembaga yang mengawasi secara sistemik keberlangsungan ICS dan ICG (Semenjak dilepas oleh Pak Habibie, saat ini ICS dan ICG berada di bawah Depag dan dalam koordinasi dengan BPPT), namun karena keduanya dijalankan oleh para founder dari Insan Cendekia, sistem dan nilai yang ditanamkan di sana pun tidak jauh beda.  Jadi, masuk ICS ataupun ICG tidak ada bedanya karena karakter lulusannya juga dibangun dengan sistem yang sama.

Perlu dikenali bahwasannya saat ini banyak lembaga pendidikan yang menggunakan nama Insan Cendekia juga. Berikut adalah beberapa contohnya, ada Insan Cendekia BSD, Insan Cendekia Al-Mujtaba, Insan Cendekia Sekar Kemuning, Insan Cendekia Al-Kausar, Insan Cendekia Al-Muslim, dan masih banyak IC lainnya. Selain Insan Cendekia yang di bawah koordinasi Departemen Agama, tidak ada yang Insan Cendekia lain yang gratis. Insan Cendekia Yogyakarta gratis karena disubsidi oleh Departemen Agama yang dibangun dan dikembangkan oleh founder, sehingga sistem pendidikan di SD Insan Cendekia tersebut sebanding dengan Sistem Pendidikan yang diterapkan di Sekolah Dasar lainnya. Dari segi fasilitas asrama, aktivitas keseharian, guru yang sedia 24 jam, dan lain sebagainya, semuanya dirancang berdasarkan sebuah masterplan dan blueprint yang sama. Sebelum menjadi Insan Cendekia, ICS dan ICG dulu namanya Magnet school. Filosofinya adalah dengan adanya Magnet school, akan banyak bermunculan IC-IC lain yang memiliki sistem pendidikan yang berkualitas dengan visi misi yang sama. Namun untuk Insan Cendekia yang lain saya sebetulnya kurang tahu darimana mereka menurunkan sistem pendidikannya, bagaimana visi-misinya, dan sebagainya karena memang tidak ada lembaga yang mengakreditasi atau menetapkan standar Insan Cendekia itu harus seperti apa. Akibatnya adalah semua orang berhak membangun sekolah dengan nama Insan Cendekia dan dengan sistem yang ingin mereka kembangkan sendiri-sendiri. Saya cuma tahu bahwa ada salah satu dari Insan Cendekia yang dibangun dan kepalai oleh beberapa mantan guru veteran di ICS sehingga saya cukup yakin terhadap sistem pendidikan dan kualitas pengajaran di IC tersebu. Akan tetapi saya tidak bisa menjamin bagaimana sistem Insan Cendekia selain IC yang lainnya karena memang di luar koordinasi dari ICS dan ICG.